107 zamoczonych książek z Biblioteki Akademii Medycznej we Wrocławiu, 600 książek z Biblioteki Wydziału Prawa Uniwersytetu Wrocławskiego zabezpieczono w Bibliotece Jagiellońskiej.
Książki zostały przywiezione transportem Uniwersytetu Jagiellońskiego 25 lipca 1997 roku. Były w bardzo złym stanie, zagrzybione, pokryte pleśnią. W Oddziale Konserwacji BJ czyszczono je, suszono, dezynfekowano i prasowano. Intensywne prace przy suszeniu trwały dwa tygodnie. Pracownicy BJ dzień i noc przekładali kartki bibułą i papierem łatwo wchłaniającym wodę. Niestety, BJ nie dysponuje specjalistycznymi urządzeniami, nie posiada komory próżniowej, dezynfekcyjnej, zamrażarki. Nie udało się uratować tylko jednej książki.
25 listopada 1997 roku BJ przekazała Bibliotece Głównej Uniwersytetu Opolskiego 1437 woluminów w 36 kartonach - głównie Zeszytów Naukowych UJ (z zasobu na wymianę), 44 tytuły z zasobu dubletów (i uzupełnienia do nich) oraz 170 tytułów z księgozbioru podręcznego wypożyczalni. Dołączono też dublety z Biblioteki Instytutu Historii UJ oraz Zeszyty Prasoznawcze Ośrodka Badań Prasoznawczych UJ.
Biblioteka Jagiellońska postanowiła przekazać książki z nowych wydawnictw tym bibliotekom, w których księgozbiór będzie tworzony od nowa w miejsce zniszczonego przez powódź. W ostatnich dniach października BJ przekazała 147 tytułów do Miejskiej Gminnej Biblioteki Publicznej w Nysie - były to dublety BJ, głównie z literatury pięknej i lektur szkolnych. Obecnie BJ przygotowuje się do zorganizowania pomocy dla Biblioteki Publicznej w Limanowej, zwłaszcza jej filii w Sowlinach, gdzie zalanych zostało ponad 4000 książek i katalogi. Oprócz 200 tytułów książek, BJ przekaże dwie szafy katalogowe, pięć maszyn do pisania i pięć stolików pod maszyny. Rozpoczęto też wśród pracowników BJ zbiórkę lektur szkolnych i książek dla dzieci.